Торжественное вручение премий Правительства Санкт-Петербурга за заслуги в области науки и образования состоялось в Смольном 29.05.2025. Премия имени Н.И. Вавилова в номинации “Биологические науки” вручена заведующей отделом биотехнологии ВИР, доктору биологических наук Татьяне Андреевне Гавриленко. Премия присуждена по результатам открытого конкурса, на который Татьяну Андреевну выдвинул Ученый Совет ВИР.
Поздравляем!
Премия имени Н.И. Вавилова вручена за цикл работ в области изучения генетического разнообразия клубнеобразующих видов рода Solanum L.
Церемония состоялась накануне отмечаемого сегодня Всемирного дня картофеля. ВИР широко известен в мире как научный центр комплексных, разносторонних фундаментальных и прикладных исследований генетических ресурсов картофеля, которые реализуются здесь на протяжении более 100 лет.
Фото предоставлено Санкт-Петербургским отделением РАН.
Среди научных результатов, полученных Татьяной Андреевной с коллегами, можно выделить следующие:
1.Результаты совместных исследований коллег из ВИР, ВИЗР и университета Мэдисон-Висконсин, США предоставили новые данные о происхождении и генетической дифференциации культурных видов картофеля (Gavrilenko et al. 2010, 2013). Полученные результаты были привлечены международным коллективом авторов, возглавляемым профессором D. Spooner (университет Мэдисон-Висконсин, США), для создания современной классификации культурных видов картофеля (Spooner et al. 2014; Ovchinnikova et al. 2011).
2.Результаты сравнительного молекулярно-генетического анализа аутентичных гербарных образцов аборигенных сортов картофеля, собранных в Южной Америке соратниками Н.И. Вавилова и сохраняемых в гербарии ВИР около 100 лет, и образцов полевых коллекций, собранных в тех же регионах во второй половине 20 века, обозначили причины генетической эрозии чилийских аборигенных сортов в 20 веке (Gavrilenko et al. 2023a). Эти исследования выполнены сотрудниками ВИР из отдела биотехнологии, отдела агроботаники и in situ сохранения генетических ресурсов растений и отдела генетических ресурсов картофеля в рамках проекта РФФИ 2015_15-04-06846.
3.С использованием современных методов молекулярной цитогенетики получены новые данные о геномном составе и происхождении диких полиплоидных североамериканских видов секции Petota Dumort. рода Solanum L. (Pendinen et al. 2008, 2012; Gavrilenko, 2011; Spooner et al. 2014). Это результаты совместных исследований сотрудников ВИР и коллег из университета Мэдисон-Висконсин, США – профессоров D. Spooner и J. Jiang. Гавриленко Т.А. являлась научным руководителем совместного проекта ISTC 3329 с российской стороны.
4.Результаты молекулярно-цитогенетических исследований (GISH/FISH анализ) спаривания гомеологичных хромосом у отдаленных гибридов и интрогрессивных форм предоставили новые данные о потенциале интрогрессивной гибридизации Solanum tuberosum с дикими видами вторичного и третичного генпулов картофеля (Gavrilenko et al 2001, 2015, 2022, 2023). Исследования выполнялись сотрудниками ВИР (Гавриленко Т.А., Пендинен Г.И., Антонова О.Ю.) в рамках проектов двустороннего российско-немецкого сотрудничества с Dr. R. Thieme и проектов РФФИ бел_а с д.б.н. Ермишиным А.П. Гавриленко Т.А. являлась научным руководителем совместных проектов с российской стороны.
5.Впервые проведены комплексные исследования генетической системы ЦМС-Rf картофеля (Анисимова, Гавриленко, 2017; Anisimova et al 2019; Shishova et al 2019; Гавриленко и др. 2019) и получены приоритетные данные о полиморфизме последовательностей гомологов RFL-PPR-генов в геноме картофеля (Anisimova et al 2019). Эти результаты были получены в рамках проекта РНФ 16-16-04-125, руководителем которого была Т.А. Гавриленко.
6.В многолетних совместных исследованиях сотрудников ВИР с коллегами из лаборатории иммунитета растений к болезням, ВИЗР (рук. д.б.н. О.С. Афанасенко) выполнена серия работ по оценке устойчивости образцов картофеля из коллекции ВИР к объектам внешнего и внутреннего карантина – бледной и золотистой цистообразующим нематодам); проведена валидация наборов ДНК-маркеров, ассоциированных с генами, контролирующими устойчивость и молекулярный скрининг образцов картофеля (Limantseva et al. 2014; Антонова и др. 2016; Клименко и др. 2019; Хютти и др. 2020; Gavrilenko et al. 2021).
В сотрудничестве с коллегами из Института цитологии и генетики Сибирского отделения Российской Академии Наук и из ВИЗР с использованием современных омиксных технологий исследуются механизмы устойчивости растений к патогенам (Kochetov et al. 2020, 2021).
7.Предложена оригинальная комплексная стратегия регистрации и сохранения в генбанках генофонда вегетативно размножаемых культур (Гавриленко, Чухина, 2020). Эту стратегию реализовывают Т.А. Гавриленко вместе со своими аспирантами, коллегами из отдела биотехнологии и отдела агроботаники и in situ сохранения генетических ресурсов растений ВИР и селекционерами – авторами сортов из ведущих селекцентров страны. В результате проведенных исследований в соответствии с рекомендациями Международного кодекса номенклатуры культурных растений оформлены номенклатурные стандарты ~100 отечественных сортов картофеля; разработаны молекулярно-генетические паспорта 93 российских сортов картофеля и изучено их генетическое разнообразие; проведена криоконсервация и закладка генотипированных сортов картофеля на долгосрочное хранение в криобанк ВИР (Клименко и др. 2020; Рыбаков и др. 2020, 2022, 2024; Фомина и др. 2020а,б; Оськина и др. 2023; Антонова и др. 2020; Ефремова и др. 2023).
Избранные публикации Т.А. Гавриленко с коллегами:
Gavrilenko T., Thieme R., V.-M. Rokka. Cytogenetic analysis of Lycopersicon esculentum (+) Solanum etuberosum somatic hybrids and their androgenic regenerants. Theoretical and Applied Genetics, 2001, 103: 231–239.
Pendinen G., T. Gavrilenko, J. Jiang, D.M. Spooner. Allopolyploid speciation of the tetraploid Mexican potato species revealed by genomic in situ hybridization. Genome. 2008, 51: 714–720.
Gavrilenko T., O. Antonova, A. Ovchinnikova, L. Novikova, E. Krylova, N. Mironenko, G. Pendinen, A. Islamshina, N. Shvachko, S. Kiru, L. Kostina, O. Afanasenko, D. Spooner. A microsatellite and morphological assessment of the Russian National Potato Collection. Genetic Resources and Crop Evolution. 2010, 57, 8: 1151–1164.
Spooner D.M., T. Gavrilenko, S.H. Jansky, A. Ovchinnikova, E. Krylova, S. Knapp, R. Simon. Ecogeography of ploidy variation in cultivated potato (Solanum sect. Petota). American Journal of Botany. 2010, 97 (12): 2049–2060.
Ovchinnikova A., E. Krylova, T. Gavrilenko, T. Smekalova, M. Zhuk, S. Knapp, D.M. Spooner. Taxonomy of cultivated potatoes (Solanum section Petota: Solanaceae). Botanical Journal of the Linnean Society. 2011, 165: 107–155.
Gavrilenko T. Application of molecular cytogenetics in fundamental and applied research of potato (Review). Chapter 9: 184–206. In: Genetics, Genomics and Breeding of Potato. Edit. J. Bradeen and C. Kole. Published by ‘Science Publishers’. 1 edition. USA. 2011. 296 pages. ISBN 978-1-57808-715-0
Pendinen G., D.M. Spooner, J. Jiang, T. Gavrilenko. Genomic in situ hybridization (GISH) reveals both auto- and allopolyploid origins of different North and Central American hexaploid potato (Solanum section Petota) species. Genome. 2012, 55: 407–415.
Gavrilenko T., O. Antonova, A. Shuvalova, E. Krylova, N. Alpatyeva, D. Spooner, L. Novikova. Genetic diversity and origin of cultivated potatoes based on plastid microsatellite polymorphism. Genetic Resources and Crop Evolution. 2013, 60 970: 1997–2015.
Spooner D.M., M. Ghislain, R. Simon, S.H. Jansky, T. Gavrilenko. Systematics, diversity, genetics, and evolution of wild and cultivated potatoes. Botanical Review. 2014, 80 (4): 283–383.
Анисимова И.Н., Гавриленко Т.А. Цитоплазматическая мужская стерильность и перспективы ее использования в селекционно-генетических исследованиях и семеноводстве картофеля. Вавиловский журнал генетики и селекции. 2017. 21(1): 83-95.
Гавриленко Т.А., Клименко Н.С., Алпатьева Н.В., Костина Л.И., Лебедева В.А., Евдокимова З.З., Апаликова О.В., Новикова Л.Ю., Антонова О.Ю. Генетическое разнообразие сортов картофеля российской селекции и стран ближнего зарубежья по типам цитоплазм. Вавиловский журнал генетики и селекции. 2019;23(6):753-764.
Anisimova I.N., Alpatieva N.V., Karabitsina Y.I., T.A. Gavrilenko. Nucleotide sequence polymorphism in the RFL-PPR genes of potato. Journal of Genetics. 2019. 98: 87.
Shishova M., Puzanskiy R., Gavrilova O., Kurbanniazov S., Demchenko K., Yemelyanov V., Pendinen G., Shavarda A., T. Gavrilenko. Metabolic Alterations in Male-Sterile Potato as Compared to Male-Fertile. Metabolites. 2019. 9(2), 24.
Kochetov A.V., Egorova A.A., Glagoleva A.Y., Strygina K.V., Khlestkina E.K., Gerasimova S.V., Shatskaya N.V., Vasilyev G.V., Afonnikov D.A., Shmakov N.A., Antonova O.Y., Alpatyeva N.V., Khiutti A.V., Afanasenko O.S., Gavrilenko T.A. The mechanism of potato resistance to Globodera rostochiensis: comparison of root transcriptomes of resistant and susceptible Solanum phureja genotypes. BMC Plant Biol special issue. 2020. 20 (Suppl 1): 350.
Kochetov A.V., Afonnikov D.A., Shmakov N.A., Vasiliev G.V., Antonova O.Y., Shatskaya N.V., Glagoleva A.Y., Ibragimova S.M., Khiutti A.V., Afanasenko O.S., T.A. Gavrilenko. NLR Genes Related Transcript Sets in Potato Cultivars Bearing Genetic Material of Wild Mexican Solanum Species. Agronomy, 2021, 11, 2426.
Гавриленко Т.А., Чухина И.Г. Номенклатурные стандарты современных российских сортов картофеля, хранящиеся в гербарии ВИР (WIR): новые подходы к регистрации сортового генофонда в генбанках. Биотехнология и селекция растений. 2020;3(3):6-17.
Рыбаков Д.А., Антонова О.Ю., Чухина И.Г., Фомина Н.А., Клименко Н.С., Желтова В.В., Мелешин А.А., Кочиева Е.З., Овэс Е.В., Апшев Х.Х., Симаков Е.А., Гавриленко Т.А. Номенклатурные стандарты и генетические паспорта сортов картофеля селекции Всероссийского научно-исследовательского института картофеля им. А.Г. Лорха. Биотехнология и селекция растений. 2020;3(4):5-52.
Антонова О.Ю., Клименко Н.С., Рыбаков Д.А., Фомина Н.А, Желтова В.В., Новикова Л.Ю., Гавриленко Т.А. SSR-анализ современных Российских сортов картофеля с использованием ДНК номенклатурных стандартов. Биотехнология и селекция растений. 2020;3(4):77-96.
Gavrilenko T.A., Pendinen G.I., Yermishin A.P. GISH Analysis of the Introgression of the B subgenome genetic material of wild allotetraploid species Solanum stoloniferum into backcrossing progenies with potato. Agronomy, 2022, 12, 787.
Nagel M., Dulloo M. E., Bissessur P, Gavrilenko T., Bamberg J., Ellis D., P. Giovannini (2022). Global Strategy for the Conservation of Potato. Global Crop Diversity Trust. Bonn, Germany.
Gavrilenko T., Chukhina I., Antonova O., Krylova E., Shipilina L.; Oskina N., Kostina L. Comparative Analysis of the Genetic Diversity of Chilean Cultivated Potato Based on a Molecular Study of Authentic Herbarium Specimens and Present-Day Gene Bank Accessions. Plants. 2023a, 12, 174.
Gavrilenko T., Pendinen G., Antonova O., Makarova T., Thieme R. Homoeologous Chromosome Pairing and Alien Introgression in Backcrossing Progenies Derived from Hybrids Solanum tuberosum (+) Mexican 2x (1 EBN) B-Genome Potato Species. Agronomy. 2023b, 13, 1809.
Ефремова О.С., Волкова Н.Н., Рыбаков Д.А., Лисицына О.В., Озерский П.В., Гавриленко Т.А. Расширение криоколлекции образцов картофеля, сохраняемой в криобанке ВИР. Труды по прикладной ботанике, генетике и селекции. 2023;184(3):9-20.
Оськина Н.А., Рыбаков Д.А., Шанина Е.П., Лисицына О.В., Чухина И.Г., Гавриленко Т.А. Комплексный подход к регистрации и сохранению сортового генофонда в генбанке ВИР на примере сортов картофеля селекции Уральского федерального аграрного научно-исследовательского центра Уральского отделения РАН. Биотехнология и селекция растений. 2023;6(2):5-26.