Кубанский генетический банк семян был организован в 1976 году. Первоначальное название – “Государственное хранилище мировой коллекции семян” (Национальное хранилище).
Национальное хранилище семян было решено создать в системе института растениеводства (ВИР) в соответствии с постановлением ВАСХНИЛ и Министерства сельского хозяйства СССР в 1972 году (приказ ВАСХНИЛ № 53 от 28 июля 1972 года) и разместить на территории Кубанской опытной станции ВИР.
Основной задачей Филиала является обеспечение длительного хранения семян коллекционных образцов «генетического фонда сельскохозяйственных культур» без существенного снижения всхожести и нарушения их генетического потенциала. А также, проведение органолептической оценки семян, определение жизнеспособности семян, их обезвоживание до оптимального уровня влажности, кодирования, герметизации и размещения в камерах хранилища, создание базы данных (в том числе электронной) о заложенных образцах семян, контроль состояния жизнеспособности семян во время хранения. Коллекционные образцы семян хранятся при температурных режимах +4,5°, -5°, -18° С.
В настоящее время в филиале Кубанского генетического банка семян в коллекциях длительного, дублетного и оперативного хранения (активная коллекция) хранится более 260 тысяч образцов 250 культур. Коллекция длительного хранения семян является стратегическим фондом и, как правило, только пополняется. Две другие – являются рабочими и служат для научно-исследовательских работ, а также для восстановления и размножения образцов семян различных сельскохозяйственных культур.
Кроме коллекции семян ВИР в Кубанском генетическом банке хранятся рабочие коллекции семян других научно-исследовательских институтов России и стран СНГ. Наиболее крупные из них коллекции семян риса Всероссийского института риса, табака и махорки Всероссийского института табака и махорки.